Tive conhecimento de um novo script PERL que ajuda na optimização do MySQL. O script em questão é o MySQLTuner.
Antes de aplicar este script aconselho a leitura do post anterior sobre a otimização do MySQL em Linux.
Instalar e correr o MySQLTuner - High-performance MySQL optimization script
Fazer o download do script
wget mysqltuner.pl
Correr o script (tem que ter o PERL instalado)